２０１６年１１月２６日至１２月２６日，中央第三环境保护督察组对湖北省开展环境保护督察。督察认为，湖北省高度重视环境保护工作，２０１６年出台湖泊保护、湿地管理、水污染防治、土壤污染防治、秸秆禁烧等多项地方性环保法规，加强环保督政。
截至２０１７年２月，督察组交办的１９２５件环境问题举报已全部办结，责令整改９１７家，立案处罚３５９家，行政拘留２３人，刑事拘留５人，问责５２２人，约谈９４５人。
然而，全省环境保护形势依旧严峻，环境保护工作力度与中央要求和群众期盼尚有差距。督察反馈会通报称，湖北全省共建成水库６２７５座，水电站１７８８座，汉江在流量减少的情况下，仍实施六级梯级开发，干流流速降低，水体自净能力下降，近年来年年发生水华。江汉平原水系发达，但上下游各自为政，建设各类涵闸、水坝上万座，水资源、水污染纠纷不断。
填湖占湖问题依然存在，武汉官莲湖西北部１０个湖边塘、硃山湖北部近２００亩水面、汤逊湖约１４５亩湖边塘均属湖北省湖泊保护条例规定应予保护的水域，但全部被划出保护范围，并作为建设用地出让，在２０１３年以后被陆续填占用于工业和房地产开发。
湖泊非法养殖污染突出。洪湖作为国家级自然保护区，管理部门长期以渔业收费代替渔政执法，截至２０１６年１１月拆围前，珍珠养殖面积达９９５０亩，围网养殖达１５．５万亩，水质从２０１１年的Ⅱ类恶化到２０１６年的Ⅳ类。
长江环境保护形势不容乐观。湖北全省长江支流总体呈现“好水变少、差水增多”的趋势。沿江部分重化工企业环境违法问题突出，沿江８市（州）８７个工业园区，近５０％未配套建设集中式污水处理厂。
督察要求，湖北省各级党委和政府正确处理水资源开发与水环境保护关系，推进水生态环境持续改善，坚决推进长江大保护，着力加强干流、主要支流和重要湖库环境综合整治，并将整改落实情况及时向社会公开。
