净水活菌是近年在水产养殖业中发展起来的，是由多种化能异养菌组成的，具有改善水质多种功能的活菌产品。它们克服了光合细菌的不足，并且有氧化、氨化、硝化、反硝化、.解磷、硫化及固氮等作用。能将虾的排泄物、残饵、生物尸体等有机物迅速分解为二氧化碳、硝酸盐、硫酸盐等，不仅净化了水质，并为单细胞藻类的繁殖提供了营养物质，促进藻类繁殖。这些藻类的光合作用，又为池内鱼、虾、微生物的呼吸、有机物的氧化分解提供氧气，循此往复，形成一个良性的生态循环，保持适于对虾生存的平衡环境，有.利于对虾的迅速生长。同时由于上述细菌的大量繁殖，在池内形成优势菌群，抑制病原微生物的滋生，减少虾病的发生。
台湾省生产的一种用于改良水质的活菌，是由氨氧化菌、硫化菌、甲烷氧化菌及纤维素分解菌等多种细菌及酵素的混合物，每克固体物含有I亿个菌体，是一种有效地清除池底有机物的产品。有粉状、粒状及液态三种，在养殖的中、后期，每立方米水体投入0.25一1.0克，可直接撤入水中，使其更多地沉于池底。污染严重处多投，轻处少投。
